Indexing
CÁC SỐ TỪ 2011-2023
Tạp chí Y Dược Học
Tóm tắt
Đặt vấn đề: Sự mất cân bằng hệ vi sinh đường ruột góp phần vào viêm mạn tính, thúc đẩy tiến triển polyp tuyến và ung thư đại trực tràng (UTĐTT). Nghiên cứu nhằm mục tiêu: (1) Đánh giá hiệu quả tách chiết DNA hệ vi sinh đường ruột từ mẫu phân bằng kit QIAamp PowerFecal Pro DNA; (2) Khảo sát hệ vi sinh vật đường ruột ở ba mẫu nghiệm phẩm (được phân lập từ các bệnh nhân polyp tuyến, UTĐTT và người bình thường) bằng kỹ thuật giải trình tự vùng V3 - V4 gene 16S rRNA. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: 30 mẫu phân (10 chứng, 10 polyp tuyến, 10 UTĐTT) được tách chiết DNA bằng kit QIAamp PowerFecal Pro DNA; mỗi nhóm chọn ngẫu nhiên 1 mẫu giải trình tự để phân tích hệ vi sinh trên hệ thống Miseq (Illumina). Kết quả nghiên cứu: Tách chiết 30 mẫu DNA đạt hiệu suất cao, giá trị trung vị nồng độ DNAlà 252,1 (IQR: 162,0 - 311,9) ng/μL, độ tinh sạch tốt, sản phẩm khuếch đại đặc hiệu (550 bp). Khảo sát được hệ vi sinh vật đường ruột ở ba mẫu cho thấy tỷ lệ ngành Firmicutes/Bacteroidota tăng ở mẫu UTĐTT so với mẫu polyp tuyến và mẫu chứng; chi Prevotella chiếm ưu thế ở mẫu polyp tuyến; các loài Fusobacterium nucleatum, Enterococcus faecalis vàStreptococcus gallolyticus không có ở mẫu chứng nhưng được phát hiện ở mẫu UTĐTT. Kết luận: Chúng tôi đã tách chiết thành công DNA từ mẫu phân, đạt tiêu chuẩn giải trình tự 16S rRNA để phân tích hệ vi sinh vật đường ruột ở bệnh nhân polyp tuyến, UTĐTT.
| Đã xuất bản | 30-03-2026 | |
| Toàn văn |
|
|
| Ngôn ngữ |
|
|
| Số tạp chí | Tập 16 Số 1 (2026) | |
| Phân mục | Nghiên cứu | |
| DOI | 10.34071/jmp.2025.6.737 | |
| Từ khóa | Fecal DNA extraction, gut microbiota sequencing, adenomatous polyps, colorectal cancer Tách chiết DNA từ mẫu phân, giải trình tự hệ vi sinh đường ruột, polyp tuyến, ung thư đại trực tràng |
công trình này được cấp phép theo Creative Commons Attribution-phi thương mại-NoDerivatives 4.0 License International .
Bản quyền (c) 2026 Tạp chí Y Dược Huế
Kim J, Gunathilake M, Yeo HY, Oh JH, Kim BC, Han N, et al. Fecal Microbial Dysbiosis is Associated with Colorectal Cancer Risk in a Korean Population. Cancer Res Treat. 2024 Jul 26;57(1):198-211.
Deng D, Zhao L, Song H, Wang H, Cao H, Cui H, et al. Microbiome analysis of gut microbiota in patients with colorectal polyps and healthy individuals. Sci Rep. 2025 Dec 1;15(1):7126.
Périchon B, Lichtl-Häfele J, Bergsten E, Delage V, Trieu-Cuot P, Sansonetti P, et al. Detection of Streptococcus gallolyticus and Four Other CRC-Associated Bacteria in Patient Stools Reveals a Potential “Driver” Role for Enterotoxigenic Bacteroides fragilis. Front Cell Infect Microbiol. 2022 Mar 11;12:794391.
Rebersek M. Gut microbiome and its role in colorectal cancer. BMC Cancer. BioMed Central Ltd; 2021 Dec;21:1325.
Fernández-Pato A, Sinha T, Gacesa R, Andreu-Sánchez S, Gois MFB, Gelderloos-Arends J, et al. Choice of DNA extraction method affects stool microbiome recovery and subsequent phenotypic association analyses. Sci Rep. 2024 Dec 1;14(1):3911.
Qiagen. QIAamp ® PowerFecal ® Pro DNA Kit Handbook. 2020.
Rezasoltani S, Aghdaei HA, Jasemi S, Gazouli M, Dovrolis N, Sadeghi A, et al. Oral Microbiota as Novel Biomarkers for Colorectal Cancer Screening. Cancers (Basel). 2023 Jan 1;15(1):192.
Illumina. 16S Metagenomic Sequencing Library Preparation. Preparing 16S Ribosomal RNA Gene Amplicons for the Illumina MiSeq System.
Lim MY, Park YS, Kim JH, Nam Y Do. Evaluation of fecal DNA extraction protocols for human gut microbiome studies. BMC Microbiol. 2020 Jul 17;20(1):212.
Kadhim FJ, Aziz ZS, Ibrahim KS. Gut Microbiome Profiles in Colorectal Cancer Patients in Iraq. Microbiol Res (Pavia). 2025 Jan 1;16(1):22.
Dong Y, Zhang K, Wei J, Ding Y, Wang X, Hou H, et al. Gut microbiota-derived short-chain fatty acids regulate gastrointestinal tumor immunity: a novel therapeutic strategy? Frontiers in Immunology. Frontiers Media S.A. 2023 Apr;14:1158200.
El Leithy AA, Youssef ASED, Nassar A, Aziz RK, Khaled NM, Mahrous MT, et al. Long-read 16S rRNA amplicon sequencing reveals microbial characteristics in patients with colorectal adenomas and carcinoma lesions in Egypt. Gut Pathog. 2025 Dec 1;17(1):8.
Shah AB, Baiseitova A, Zahoor M, Ahmad I, Ikram M, Bakhsh A, et al. Probiotic significance of Lactobacillus strains: a comprehensive review on health impacts, research gaps, and future prospects. Gut Microbes. Taylor and Francis Ltd. 2024 Jan-Dec;16(1):2431643.
Lo CH, Wu DC, Jao SW, Wu CC, Lin CY, Chuang CH, et al. Enrichment of Prevotella intermedia in human colorectal cancer and its additive effects with Fusobacterium nucleatum on the malignant transformation of colorectal adenomas. J Biomed Sci. 2022 Dec 1;29(1):88.
Ou S, Wang H, Tao Y, Luo K, Ye J, Ran S, et al. Fusobacterium nucleatum and colorectal cancer: From phenomenon to mechanism. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Frontiers Media S.A. 2022 Nov 29;12:1020583.
Zhang L, Liu J, Deng M, Chen X, Jiang L, Zhang J, et al. Enterococcus faecalis promotes the progression of colorectal cancer via its metabolite: biliverdin. J Transl Med. 2023 Feb 2;21(1):72.
Eldegla HE, Abdel-Wahhab M, Moemen D. Association between Streptococcus gallolyticus and colorectal cancer in Mansoura University hospitals. Egyptian Journal of Basic and Applied Sciences. 2021;8(1):397-406.
Dadgar-Zankbar L, Shariati A, Bostanghadiri N, Elahi Z, Mirkalantari S, Razavi S, et al. Evaluation of enterotoxigenic Bacteroides fragilis correlation with the expression of cellular signaling pathway genes in Iranian patients with colorectal cancer. Infect Agent Cancer. 2023 Dec 1;18(1):48.